Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
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Nop56Q9D6Z1 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Nop56Q9D6Z1 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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