Protein–RNA interactions for Protein: Q9D665

Sdr42e1, Short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr42e1Q9D665 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sdr42e1Q9D665 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms