Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Ptp4a3Q9D658 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Ptp4a3Q9D658 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Ptp4a3Q9D658 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Ptp4a3Q9D658 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Ptp4a3Q9D658 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Ptp4a3Q9D658 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ptp4a3Q9D658 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms