Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

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Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Efhd1Q9D4J1 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Efhd1Q9D4J1 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms