Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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