Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ube2cQ9D1C1 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ube2cQ9D1C1 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
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Ube2cQ9D1C1 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ube2cQ9D1C1 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ube2cQ9D1C1 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
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Ube2cQ9D1C1 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ube2cQ9D1C1 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ube2cQ9D1C1 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ube2cQ9D1C1 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
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Ube2cQ9D1C1 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
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Ube2cQ9D1C1 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ube2cQ9D1C1 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ube2cQ9D1C1 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ube2cQ9D1C1 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
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Ube2cQ9D1C1 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ube2cQ9D1C1 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ube2cQ9D1C1 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
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Ube2cQ9D1C1 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
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Ube2cQ9D1C1 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
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Ube2cQ9D1C1 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ube2cQ9D1C1 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ube2cQ9D1C1 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ube2cQ9D1C1 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ube2cQ9D1C1 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
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Ube2cQ9D1C1 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ube2cQ9D1C1 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
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Ube2cQ9D1C1 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
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Ube2cQ9D1C1 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ube2cQ9D1C1 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ube2cQ9D1C1 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ube2cQ9D1C1 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ube2cQ9D1C1 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ube2cQ9D1C1 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ube2cQ9D1C1 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ube2cQ9D1C1 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Ube2cQ9D1C1 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Ube2cQ9D1C1 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Ube2cQ9D1C1 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
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Ube2cQ9D1C1 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms