Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms