Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Ddx28Q9CWT6 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
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Ddx28Q9CWT6 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Ddx28Q9CWT6 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Ddx28Q9CWT6 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Ddx28Q9CWT6 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Ddx28Q9CWT6 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Ddx28Q9CWT6 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ddx28Q9CWT6 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Ddx28Q9CWT6 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Ddx28Q9CWT6 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Ddx28Q9CWT6 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
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Ddx28Q9CWT6 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ddx28Q9CWT6 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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