Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms