Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms