Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ergic3Q9CQE7 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ergic3Q9CQE7 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ergic3Q9CQE7 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ergic3Q9CQE7 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ergic3Q9CQE7 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ergic3Q9CQE7 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ergic3Q9CQE7 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ergic3Q9CQE7 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ergic3Q9CQE7 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ergic3Q9CQE7 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ergic3Q9CQE7 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ergic3Q9CQE7 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ergic3Q9CQE7 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ergic3Q9CQE7 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ergic3Q9CQE7 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ergic3Q9CQE7 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ergic3Q9CQE7 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ergic3Q9CQE7 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ergic3Q9CQE7 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ergic3Q9CQE7 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ergic3Q9CQE7 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ergic3Q9CQE7 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ergic3Q9CQE7 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ergic3Q9CQE7 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ergic3Q9CQE7 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ergic3Q9CQE7 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ergic3Q9CQE7 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ergic3Q9CQE7 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ergic3Q9CQE7 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ergic3Q9CQE7 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ergic3Q9CQE7 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ergic3Q9CQE7 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ergic3Q9CQE7 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ergic3Q9CQE7 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ergic3Q9CQE7 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Ergic3Q9CQE7 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Ergic3Q9CQE7 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Ergic3Q9CQE7 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Ergic3Q9CQE7 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.3 ms