Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Atp6v0e1Q9CQD8 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Atp6v0e1Q9CQD8 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Atp6v0e1Q9CQD8 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Atp6v0e1Q9CQD8 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Atp6v0e1Q9CQD8 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Atp6v0e1Q9CQD8 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Atp6v0e1Q9CQD8 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Atp6v0e1Q9CQD8 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Atp6v0e1Q9CQD8 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Atp6v0e1Q9CQD8 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Atp6v0e1Q9CQD8 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Atp6v0e1Q9CQD8 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Atp6v0e1Q9CQD8 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Atp6v0e1Q9CQD8 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Atp6v0e1Q9CQD8 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Atp6v0e1Q9CQD8 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
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Atp6v0e1Q9CQD8 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Atp6v0e1Q9CQD8 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Atp6v0e1Q9CQD8 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
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Atp6v0e1Q9CQD8 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Atp6v0e1Q9CQD8 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Atp6v0e1Q9CQD8 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Atp6v0e1Q9CQD8 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
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Atp6v0e1Q9CQD8 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Atp6v0e1Q9CQD8 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
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Atp6v0e1Q9CQD8 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Atp6v0e1Q9CQD8 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Atp6v0e1Q9CQD8 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Atp6v0e1Q9CQD8 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
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Atp6v0e1Q9CQD8 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
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Atp6v0e1Q9CQD8 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Atp6v0e1Q9CQD8 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
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Atp6v0e1Q9CQD8 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
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Atp6v0e1Q9CQD8 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
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Atp6v0e1Q9CQD8 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
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Atp6v0e1Q9CQD8 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Atp6v0e1Q9CQD8 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
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Atp6v0e1Q9CQD8 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Atp6v0e1Q9CQD8 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Atp6v0e1Q9CQD8 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Atp6v0e1Q9CQD8 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Atp6v0e1Q9CQD8 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Atp6v0e1Q9CQD8 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Atp6v0e1Q9CQD8 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Atp6v0e1Q9CQD8 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Atp6v0e1Q9CQD8 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Atp6v0e1Q9CQD8 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Atp6v0e1Q9CQD8 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Atp6v0e1Q9CQD8 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Atp6v0e1Q9CQD8 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Atp6v0e1Q9CQD8 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
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