Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp2Q9CQ73 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkp2Q9CQ73 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms