Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg3Q9CPX6 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms