Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Prpf8Q99PV0 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms