Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE9

Pbx4, Pre-B-cell leukemia transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbx4Q99NE9 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 2410152P15Rik-201ENSMUST00000137405 871 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 Gm46210-201ENSMUST00000218800 577 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 Gm12248-203ENSMUST00000219877 1160 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Pbx4Q99NE9 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 Gm6741-201ENSMUST00000057074 1330 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 AC154354.1-203ENSMUST00000225565 1364 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Pbx4Q99NE9 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Pbx4Q99NE9 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Pbx4Q99NE9 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Pbx4Q99NE9 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Pbx4Q99NE9 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 Gm26174-201ENSMUST00000158415 219 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 Gm26626-201ENSMUST00000180989 713 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 Gm7765-201ENSMUST00000182585 974 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 Gm43726-201ENSMUST00000199110 775 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 1810059H22Rik-207ENSMUST00000204809 289 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 Gm6518-201ENSMUST00000208450 342 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 Olfr1335-202ENSMUST00000219094 1148 ntAPPRIS P2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 AC107752.1-201ENSMUST00000219362 469 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pbx4Q99NE9 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms