Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl43Q99N89 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl43Q99N89 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms