Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pagr1aQ99L02 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pagr1aQ99L02 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pagr1aQ99L02 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pagr1aQ99L02 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pagr1aQ99L02 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pagr1aQ99L02 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pagr1aQ99L02 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pagr1aQ99L02 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pagr1aQ99L02 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pagr1aQ99L02 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pagr1aQ99L02 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pagr1aQ99L02 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pagr1aQ99L02 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pagr1aQ99L02 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pagr1aQ99L02 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pagr1aQ99L02 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pagr1aQ99L02 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pagr1aQ99L02 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pagr1aQ99L02 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pagr1aQ99L02 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pagr1aQ99L02 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pagr1aQ99L02 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pagr1aQ99L02 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pagr1aQ99L02 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pagr1aQ99L02 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pagr1aQ99L02 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pagr1aQ99L02 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pagr1aQ99L02 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.8 ms