Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms