Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
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