Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms