Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps3Q91VB4 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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