Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEM9

Klhdc3, Kelch domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc3Q8VEM9 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Klhdc3Q8VEM9 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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