Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms