Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Colec12Q8K4Q8 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Colec12Q8K4Q8 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Colec12Q8K4Q8 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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Colec12Q8K4Q8 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Colec12Q8K4Q8 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Colec12Q8K4Q8 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Colec12Q8K4Q8 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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Colec12Q8K4Q8 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.3 ms