Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Usp27Q8CEG8 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Usp27Q8CEG8 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Usp27Q8CEG8 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Usp27Q8CEG8 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Usp27Q8CEG8 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Usp27Q8CEG8 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Usp27Q8CEG8 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Usp27Q8CEG8 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Usp27Q8CEG8 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Usp27Q8CEG8 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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