Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC35

Synpo, Synaptopodin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 929 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynpoQ8CC35 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms