Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms