Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms