Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Usp38Q8BW70 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Usp38Q8BW70 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
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