Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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