Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnrc6bQ8BKI2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms