Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Atg4bQ8BGE6 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Atg4bQ8BGE6 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.4 ms