Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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