Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NischQ80TM9 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NischQ80TM9 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
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