Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
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