Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Ccdc88cQ6VGS5 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Ccdc88cQ6VGS5 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Ccdc88cQ6VGS5 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Ccdc88cQ6VGS5 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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