Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Trim37Q6PCX9 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Trim37Q6PCX9 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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Trim37Q6PCX9 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trim37Q6PCX9 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trim37Q6PCX9 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trim37Q6PCX9 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim37Q6PCX9 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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