Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Usp49Q6P9L4 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Usp49Q6P9L4 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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