Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Smchd1Q6P5D8 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms