Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms