Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms