Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
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