Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms