Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

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Length 993 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Sycp1Q62209 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Sycp1Q62209 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sycp1Q62209 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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