Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.7 ms