Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Atf3Q60765 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Atf3Q60765 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Atf3Q60765 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Atf3Q60765 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Atf3Q60765 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Atf3Q60765 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Atf3Q60765 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Atf3Q60765 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Atf3Q60765 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Atf3Q60765 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Atf3Q60765 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Atf3Q60765 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Atf3Q60765 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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