Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms