Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms