Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Lct-201ENSMUST00000073490 6174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Plec-217ENSMUST00000169438 14827 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Tenm2-202ENSMUST00000102801 9908 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Tyw3-201ENSMUST00000052774 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 G3bp1-201ENSMUST00000018727 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Heatr6-201ENSMUST00000001002 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Sec22c-201ENSMUST00000078547 5713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Shank2-205ENSMUST00000146006 7666 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Zfp324-201ENSMUST00000038701 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 A830010M20Rik-208ENSMUST00000211896 5256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Ccdc186-202ENSMUST00000118592 6445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Rbbp6-201ENSMUST00000052135 6184 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Ddr1-203ENSMUST00000117301 3874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Aff1-201ENSMUST00000031256 8312 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Dspp-201ENSMUST00000112771 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.04
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